Tuija Hakkila ha studiato all'Accademia Sibelius con Liisa Pohjola ed Eero Heinonen, poi al Conservatorio di Parigi con Jacques Rouvier e Theodor Paraskivesco. Ha approfondito la sua conoscenza della musica del XX secolo con Claude Helffer a Parigi e delle pratiche di interpretazione classica con Malcolm Bilson negli Stati Uniti. Tra i suoi altri professori influenti figurano György Sebök, William Pleeth e Dmitri Bashkirov. Nel 1985-1986, è stata borsista Fulbright alla Columbia University di New York.

Dal 1987, occupa una posizione senior in musica per pianoforte all'Accademia Sibelius, dove ha ottenuto un dottorato in musica nel 2005. Dal 2005 al 2008, ha anche insegnato al Conservatorio Reale di Danimarca a Copenaghen. Tiene regolarmente masterclass in Finlandia e in Europa.

Tuija Hakkila è stata direttrice artistica di diversi eventi e serie, tra cui il Festival di Musica Antica di Hämeenlinna, l'Accademia Estiva e la serie di musica da camera di Nurmes, il Festival Kaiho di Espoo e la serie di concerti dell'Accademia Sibelius.

Si è esibita come solista, membro di gruppi di musica da camera e accompagnatrice in tutta Europa, negli Stati Uniti, in Giappone, Indonesia, Africa e Sud America. Ha collaborato con musicisti eminenti come Vera Beths, Anner Bijlsma, Mikael Helasvuo, Sirkka-Liisa Kaakinen-Pilch, Anssi Karttunen, Alexei Lubimov, Karita Mattila, e ha suonato sotto la direzione di direttori come Okko Kamu, Jukka-Pekka Saraste, Leif Segerstam e Sakari Oramo. Il suo repertorio spazia da Bach alla musica contemporanea, con un interesse particolare per gli strumenti d'epoca, in particolare il fortepiano. Lavora con compositori contemporanei ed è spesso invitata a dare prime mondiali.

La sua discografia solistica comprende l'integrale delle sonate per tastiera di Mozart, acclamata dalla stampa, nonché registrazioni con vari ensemble di musica da camera.

Tuija Hakkila è professoressa all'Accademia Sibelius.